國務院批准文化部確定的第二批國家級非物質文化遺產名錄，共計510項，其中傳統醫藥共計8項。包括中醫養生（藥膳八珍湯、靈源萬應茶、永定萬應茶）；傳統中醫藥文化（鶴年堂中醫藥養生文化、九芝堂傳統中藥文化、潘高壽傳統中藥文化、陳李濟傳統中藥文化、同濟堂傳統中藥文化）；蒙醫藥（贊巴拉道爾吉溫針、火針療法）；?族醫藥（痧症療法、六神經絡骨通藥製作工藝）；瑤族醫藥（藥浴療法）；苗醫藥（骨傷蛇傷療法、九節茶藥製作工藝）；侗醫藥（過路黃藥製作工藝）；回族醫藥（張氏回醫正骨療法、回族湯瓶八診療法）。

第一批國家級非物質文化遺產擴展項目名錄，共計147項，其中，傳統醫藥共計5項。包括中藥炮製技術（四大懷藥種植與炮製、中藥炮製技藝）；中醫傳統製劑方法（龜齡集傳統製作技藝、雷允上六神丸製作技藝、東阿阿膠製作技藝、廖氏化風丹製作技藝）；針灸（劉氏刺熨療法）；中醫正骨療法（宮廷正骨、羅氏正骨法、石氏傷科療法、平樂郭氏正骨法）；藏醫藥（藏醫外治法、藏醫尿診法、藏醫藥浴療法、甘南藏醫藥、藏藥炮製技藝、藏藥七十味珍珠丸配伍技藝、藏藥珊瑚七十味丸配伍技藝、藏藥阿如拉炮製技藝、七十味珍珠丸賽太炮製技藝）。